После изгнания французов, Папа едет во Флоренцию, чтобы заставить замолчать Савонаролу, в то время как Чезаре отправляется в Форли разобраться с Катериной Сфорца. Во Флоренции Папа на встрече с Пьеро Медичи и Никколо Макиавелли обсуждает возможные способы избавления от Савонаролы. Чезаре передает Катерине ультиматум - либо приехать в Рим на поклон Папе добровольно либо закованой в цепях, но, несмотря на отказ, продолжает пользоваться её полным расположением. Делла Ровере вновь встречается с Савонаролой - на этот раз, чтобы получить его благословение на убийство Папы Борджиа. Для реализации своего плана он возвращается в аббатство, где находит самоотверженного союзника - молодого монаха по имени Антонелло, готового пожертвовать собой во избавление от Борджиа. Папа возвращается в Рим, во время проводимого им причастия, купол собора Святого Петра разрушается - Папа трактует это, как проявление гнева божьего, и твердо решает исправиться...