Spike Spiegel, um rapaz com o passado misterioso e Jet Black, um ex-polícia, se unem para ir atrás de criminosos que possuem a cabeça a prémio, dentro da nave “Bebop”. Ao longo do caminho eles encontram com personagens nada comuns, um cão muito raro que possui grande inteligência, Ein, a gananciosa e fatal Faye Valentine e muitos outros.