La serie si svolgerà in futuro nella città di Gōha e i protagonisti saranno Yūga Ōdō, uno studente di quinta elementare che ama sia le invenzioni che i duelli, il suo compagno di classe Luke, duellante numero uno alla scuola elementare di Gōha 7 e Gakuto, presidente del consiglio studentesco della scuola e Romin, il compagno di classe di Yūga. Essi si sfideranno in duelli dove vigerà una nuova regola denominata "Rush Duel".